佛罗里达自然历史博物馆伟德注册的一组科学家发布了行动呼吁利用大数据来解决有关植物多样性和进化的长期问题,并预测在一个日益由人类主导的星球上,植物的生命将如何发展。

在一个今天发表的评论在自然植物中,科学家们敦促他们的同事利用在他们的研究中开放访问数据资源,并通过填补剩余的数据空白来帮助增长这些资源。

“利用大数据解决全球范围内的主要生物多样性问题具有巨大的现实意义,从保护工作到预测和缓冲气候变化的影响,“研究作者DougSoltis说,佛罗里达州博物馆馆长,佛罗里达大学生物系杰出教授。“十年前,我们看到的大数据资源之间的联系是无法想象的。充分利用这些工具和应用程序的时机已经成熟,不仅对植物,而且对所有的有机体。”“

干燥植物标本

来自数百万博物馆标本的数据,比如说席拉塔或佛罗里达大枣,现在世界各地的科学家都可以通过数字数据库(如IDigbio)获得这些信息。杰夫·盖奇拍摄的佛罗里达博物馆照片

几个世纪以来,自然历史博物馆收集了数十亿个标本及其相关数据,其中大部分现在都可以在线使用。诸如遥感器和无人机等新技术使科学家能够实时监测植物和动物并传输数据。公民科学家通过数字工具,如非自然学家,来记录和报告他们的观察结果,从而提供生物数据。

一起,这些数据资源为科学家和自然资源保护者提供了大量关于过去的信息,地球上生命的现在和未来。随着这些数据库的增长,因此,不仅需要分析计算工具,而且还需要连接巨大的数据集。

以前专注于少数物种或单一植物群落的研究现在可以扩展到全球水平,由于数据库的发展,如基因银行,储存DNA序列,,伊迪比奥,佛罗里达大学领导的美国数字化工作自然历史收藏,以及生物多样性信息机构,物种位置信息的存储库。

这些资源对广泛的用户都是有价值的,从追求对植物进化和生态的基本洞察的科学家到寻找最需要保护的地区的土地管理者和决策者,朱莉·艾伦说,合著者,内华达大学雷诺生物系助理教授。

如果地球上的植物是个医学病人,小规模的研究可能会检查植物相当于一个冷疮或一个向内生长的脚趾甲。有了大数据,科学家可以更清楚地了解全球植物的整体健康状况,及时诊断,制定正确的治疗方案。

急需这样的计划,艾伦说。

“我们正处在这个激动人心、令人恐惧的时刻,在这个时刻,我们所能获得的史无前例的数据量与全球生物多样性威胁(如栖息地丧失和气候变化)相交叉,“艾伦说,曾任佛罗里达博物馆博士后研究员和UF博士研究生。“了解塑造我们世界的过程——植物是如何运作的,他们现在的位置和原因可以帮助我们掌握他们对未来变化的反应。”“

为什么跟踪这些地区和全球变化如此重要??

“没有植物我们无法生存,“合著者兼博物馆研究助理RyanFock说。“许多群体在开花植物的阴影下进化。随着这些植物的蔓延和多样化,蚂蚁也是这样,甲虫,蕨类和其他有机体。它们是我们今天在地球上看到的生命多样性的基础。”“

除了使用和种植植物数据资源外,作者们希望科学界能够解决使用生物大数据的最困难的障碍之一:让数据库彼此顺利地工作。

“这仍然是一个巨大的限制,“艾伦说。“每个系统中的数据通常以完全不同的方式收集。将它们集成到无缝连接中是一个重大挑战。”“

佛罗里达博物馆的罗伯特·古拉尼克,生物多样性信息学副馆长,帕梅拉·索蒂斯,尊敬的教授,分子系统学和进化遗传学博物馆馆长兼UF生物多样性研究所所长,同时也是这项研究的合著者。


资料来源:Doug Soltis,dsoltis@ufl.edu,,352-263-1963;;
Julie Allenjallen23@unr.edu,,75-82-938;;
瑞安民间邮箱:rfolk@flmnh.ufl.edu

作者

通过娜塔莉·范·胡斯γ纳塔莉的更多文章

•进BV伟德体育下载betvicror注册一步了解分子系统学与进化遗传学实验室在佛罗里达博物馆。